Akupunkturda kullanılan noktalar vücudun ecza deposu gibi çalışarak migren ağrılarının giderilmesinde önemli rol oynar. Akupunkturla güçlü bir ağrı kesici olan endorfin harekete geçer ve kişinin ağrı eşiğinde artış meydana gelir. Akupunktur tedavisiyle vücuttaki sakinleştirici maddeler de harekete geçirilir. Örneğin vücuttaki serotonin artışı, kişinin kaygılarının azalmasına, rahatlamasını sağlar. Bunun sonucunda da ağrı ve beraberinde oluşan kusma, bulantı ile kendini gösteren migrenin etkilerine karşı kişide rahatlama sağlanır. Akupunktur yan etkisi bulunmayan bir tedavi yöntemi olarak migrende kalıcı iyileşme sağlamasının yanı sıra, migrenle birlikte seyir gösteren başka hastalıklarda da iyileşme sağlar.