Otistik çocukların aslında yüzde 100'ü yakını sağlıklı bir beyinle doğar, ancak bozulan bağırsak florası yüzünden beyin toksin yükü altında kalır. Otizmli çocukların hepsinde, bağırsaklar başta olmak üzere; sindirim sistemi sorunludur. 

Bu nedenle otizmin tedavisinde sağlıklı bir diyet çok önemlidir. Özellikle GAPS diyeti otizm, disleksi, hiperaktivite gibi pek çok hastalığın tedavisinde yardımcıdır. 

Bu çocuklarda sağlıklı beslenme planının bir uzman tarafından yapılması  ve erken evrede diyete başlanması çok önemlidir.